فاطمه مهاجرانی در خصوص موضوع اتباع و مشکلاتی که برای اتباع مجاز افغانستانی به‌وجود آمده است، اظهار کرد: یقیناً دولت موضوع اتباع مجاز [افغانستانی] را از اتباع غیرمجاز [افغانستانی] تفکیک می‌کند؛ در این زمینه توجه دولت بر این است که اتباع غیرمجاز را به کشورشان برگرداند و طبق قوانین به اتباع مجاز اجازه اقامت داده شود.
وی در پاسخ به سوال دیگری در خصوص ارائه آماری از اتباع مجاز و غیر مجاز خواستار آن شد که با وزارت کشور بررسی‌های لازم را به عمل آورد و بعداً آن را اعلام کند.