به گزارش سرویس ورزش ساعدنیوز، کریم باقری فوتبال خود را با تیم تراکتورسازی شروع کرد. او نخستین بار در هفته پنجم مسابقات لیگ آزادگان مقابل استقلال در ورزشگاه آزادی و در حالی که 17 سال داشت، به میدان رفت.
باقری در ابتدای دوران فوتبال خود در پست دفاع بازی می‌کرد. او در نخستین فصل حضور در تراکتورسازی 15 بازی انجام داد و یک گل به ثمر رساند. اولین گل باقری حاصل یک ضربه پنالتی بود که وارد دروازه سپاهان شد. باقری در دومین فصل حضور در تراکتورسازی به تیم ملی جوانان دعوت شد.