به گزارش سرویس هنر و رسانه ساعدنیوز، مریم میرزاخانی متولد 22 اردیبهشت 1356 (12 مه 1977) در تهران است. پدر مریم میرزاخانی(احمد میرزاخانی) اهل طالقان استان البرزو مهندس برق و رئیس هیئت مدیره مجتمع آموزشی نیکوکاری رعد بود. او دارای سه خواهر و برادر بود. والدین مریم میرزاخانی آرزو داشتند فرزندانشان وارد عرصه های با ارزش شوند اما هیچ وقت آن ها را در مورد درس تحت فشار قرار ندادند.
در سال 1384 مریم میرزاخانی با یان واندراک اهل جمهوری چک ازدواج کرد. همسر او دانشیار ریاضی دانشگاه استنفورد و پژوهشگر سابق علوم رایانه نظری مرکز تحقیقات آی بی ام است.
مریم میرزاخانی و یان واندراک پس از ازدواج صاحب فرزند دختری شدند که او را آناهیتا نامیدند. یکی از آرزوهای خانم میرزاخانی، اعطای تابعیت ایرانی به دخترش بود. این رویا در زمان حیاتش عملی نشد اما پس از آن مجلس شورای اسلامی با هدف اجرای وصیت او، برای تسریع در اصلاح قانون تابعیت ایران وارد عمل شد و «کلیات لایحه اصلاح قانون تعیین تکلیف تابعیت فرزندان حاصل از ازدواج زنان ایرانی با مردان خارجی» به تصویب نمایندگان رسید.